GERT: GENNET Endometrium Receptivity test
Materiál:
Rychlý popis testu:
Detailní informace o testu:
Gennet Endometrium Receptivity Test (GERT) je diagnostický test určený k vyšetření receptivity děložní sliznice (tzv. endometria). Pro zdárný embryotransfer při asistované reprodukci je důležitá nejen implantace kvalitního embrya, ale i čas, kdy je embryo transferováno. Úkolem GERT je zjistit vhodnou dobu, kdy je endometrium pro embryo správně receptivní. Metodou GERT analyzujeme děložní sliznici na molekulární úrovni a stanovujeme tzv. implantační okno, tedy čas, kdy je endometrium správně vnímavé pro přenos embrya. Nedostatečná receptivita endometria může negativně ovlivnit uhnízdění embrya a tím i úspěšnost asistované reprodukce, proto je vyšetření vhodné zejména pro ženy s opakovanými neúspěšnými embryotransfery. Za účelem tohoto vyšetření je odebrána tkáň endometria pro vyšetření RNA. Biopsie tkáně endometria a vyšetření RNA probíhá optimálně v předchozím cyklu než je plánována implantace embrya. Z odebrané tkáně se izoluje mRNA, jenž se následně reverzně transkribuje na komplementární cDNA. Z ní je připravena sekvenační knihovna, která je následně sekvenována na sekvenátorech platformy Illumina. Sekvenační data jsou nahrána do aplikace ChromGo ve formě fastq, kde dochází k analýze a vydání informace o receptivitě endometria.
Cílem GERT je detekovat expresi relevantních genů na úrovni mRNA v čase odběru. Míra exprese je určena pomocí FPKM (Fragments Per Kilobase Milion), které jsou dále zpracovávány a pomocí bioinformatických výpočtů porovnávány s tzv. transkriptomickým profilem endometria. Tento profil byl definován pro krátké receptivní období a díky němu byl vytvořen predikční model, jenž spolehlivě identifikuje receptivní, prereceptivní a postreceptivní fázi a konkrétní implantační okno.