Vyšetření mutačního statusu genu TPMT alely *1, *2, *3A, *3B, *3C (mutace c.238G>C, c.460G>A a c.719A>G)

Test hrazený ze ZP:
ANO
Indikující odbornost:
208
Pohlaví:
Žena/Muž
Materiál:
Periferní krev, Bukální stěr …
Doba vyšetření:
3 týdny
STATIM:
3 dny

Materiál:

Periferní krev | 1x 3 ml plné krve v K3 EDTA zkumavce
Skladování po vyšetření: týden po vydání zprávy 2 – 8°C
Bukální stěr | 2x stěrová tyčinka pro odběr bukálního stěru
Skladování po vyšetření: týden po vydání zprávy 2 – 8°C
Izolovaná DNA z krve | 10-100 ng/μL izolované DNA z krve v PCR zkumavce o objemu min. 15 µl.
Skladování po vyšetření: skladuje se v archivu DNA bez omezení 15°C

Rychlý popis testu:

Vyšetření genu TPMT se provádí pomocí PCR a reverzní hybridizace na stripu za účelem detekce alely *1, *2, *3A, *3B, *3C (mutace c.238G>C, c.460G>A a c.719A>G), které jsou zodpovědné za sníženou aktivitu tohoto enzymu katalyzujícího složky thiopurinových léčiv užívaných v léčbě nádorů.

Detailní informace o testu:

Gen TPMT kóduje Thiopurin S-methyltransferázu, která je zásadním enzymem pro biodegradaci thiopurinů. Mezi thiopuriny patří protinádorová léčiva thioguanin a merkaptopurin, používaná zejména v hematoonkologii, a imunosupresivum azathiopirin, určený k terapii autoimunitních onemocnění a prevenci rejekce transplantátu. Mezi nežádoucí účinky při odbourávání thiopurinů patří neurotoxicita, hepatotoxicita, myelosuprese a záněty sliznic. Snížená metabolická aktivita enzymu TPMT je důsledkem přítomnosti funkčních polymorfismů v kódující oblasti genu TPMT, z nichž mezi nejčastější deficitní alely v evropské populaci patří TPMT2, TPMT3A a TPMT3C a méně častá TPMT3B. Klinické projevy deficitu TPMT mohou být závažné pro pacienty, kteří jsou heterozygoty nebo homozygoty pro funkčně variantní alely.

Vyšetření genu TPMT se provádí za účelem detekce alel *1, *2, *3A, *3B, *3C (mutace c.238G>C, c.460G>A a c.719A>G). Metoda reverzní hybridizace na stripech funguje na principu assaye sloužící k identifikaci více genových polymorfismů během jednoho experimentu, a je založena na kombinaci polymerázové řetězové reakce (PCR) a reverzní hybridizace. Proces zahrnuje PCR amplifikaci za užití biotinylovaných primerů, a hybridizaci amplifikovaných produktů na testovací proužky (stripy), obsahující imobilizované, alelově specifické oligonukleotidové próby. Vizualizace hybridizační reakce probíhá díky reakci streptavidin-alkalinových fosfatáz a barevných substrátů. Výhodou této metody je, že lze vzorek otestovat na přítomnost mnoha polymorfismů v rámci jednoho experimentu za použití dvou multiplexových PCR reakcí.

Indikace

Vyšetření mutačního status genu TPMT je součást farmakogenetického algoritmu pro individualizaci dávek léčiva před podáním thiopurinových léčiv.

zpět na výpis