Familiární hypercholesterolémie - FH test

Pro analýzu familiární hypercholesterolémie (FH test) je použita metoda SNP array s chipy Global Screening Array-24 v3.0 varianta DTC booster. Data jsou načtena do vyhodnocovacích programů: GenomeStudio a GLOBAL. Výsledkem zpracování dat těmito softwary je genotypizace anotovaných markerů (rs) a vyhodnocení vlivu na familiární hypercholesterolemii. FH test vyšetřuje mutace s významným klinickým efektem v české populaci, v evropské populaci a mutace uváděné v mezinárodních zdrojích (753 mutací genu LDLR, 27 mutací genu PCSK9 a 6 mutací genu APOB). Technika SNP array umožňuje také detekci velkých genomických přestaveb (delecí a duplikací) v oblasti vyšetřovaných genů.

Polygenní LDL-C 6SNP rizikové skóre (GLGC weight score) vyšetřuje šest variant různých genů včetně haplotypu APOE a jejich vážený účinek na hodnoty LDL-C. Pacienti s hodnotou rizikového skóre patřící do skupiny 20% nejvyšších hodnot skóre (horní dva decily) mají nejvyšší riziko polygenní FH. Rizikové skóre ovlivňuje i efekt mutace genu velkého účinku. Genotyp také ovlivňuje účinnost a riziko vedlejších účinků léčby FH - hlavně nejčastěji používaných léčiv snižujících hodnoty LDL-C ze skupiny statinů. Pro odhad efektivity a rizika nežádoucích účinků statinové léčby FH test vyšetřuje přítomnost variant genů SLCO1B1, CYP2C9, APOE a ABCG2.

Pro odhad polygenního rizika aterosklerózy a míry efektivity statinové léčby FH test vypočítává polygenní rizikové skóre (PRS) z 64 variant genů malého účinku. U pacientů s hodnotami PRS patřícími do skupiny 20% nejvyšších hodnot (horní dva decily) je očekáván nejvyšší efekt statinové léčby. FH test také vyšetřuje přítomnost 16 vzácných variant genu PCSK9 se zvýšenou funkcí (Gain-of-Function), jejichž průkaz může podpořit úvahu o indikaci inhibitorů PCSK9.