cfDNA test GENNET
O28.5, O35.1, O35.2
Materiál:
Rychlý popis testu:
Detailní informace o testu:
Neinvazivní prenatální test (NIPT) cfDNA Test GENNET zjišťuje zastoupení fragmentů deoxyribonukleové kyseliny (cfDNA) volně kolujících v mateřské plazmě podle jejich příslušnosti k chromozomům. Odchylky od očekávaného zastoupení fragmentů, které jsou směsí DNA pocházející z buněk placenty a buněk matky, zvyšují riziko změny počtu (aneuploidie) daného chromozomu nebo jeho části (strukturální aberace) plodu. cfDNA Test GENNET využívá CE-IVD certifikovanou automatizovanou technologii, protokol i datovou analýzu VeriSeq NIPT v2 Solution firmy Illumina.
Je možno zvolit dva typy stanovení rizik (screeningu) aneuploidií - základní a celogenomový.
Základní screening je zaměřen na rizika nejčastějších aneuploidií: zmnožení (trisomie) chromozomu č. 21 způsobujícího Downův syndrom, č. 18 (Edwardsův syndrom), č. 13 (Patauův syndrom) a aneuploidie pohlavních chromozomů X a Y, které jsou příčinou Turnerova syndromu, Klinefelterova syndromu, Syndromu Jacobsové a Tripple X syndromu.
Celogenomový screening méně častých (doprovodných) nálezů vyšetřuje aneuploidie všech chromozomů a jejich částečné zmnožení (duplikace) a ztráty (delece) o velikosti minimálně 7Mb.
U obou typů screeningu je možno zvolit, zda bude vyšetřováno pohlaví plodu.
cfDNA Test GENNET odhalí více než 99 % aneuploidií chromozomu č.21, č.18 a č.13 s falešnou pozitivitou nižší než 1 % (to když pozitivní výsledek NIPT testu není potvrzen přímým vyšetřením plodu amniocentézou). Citlivost testu je nižší a falešná pozitivita vyšší u aneuploidií pohlavních chromozomů X a Y a doprovodných nálezů. Tyto chromozomální odchylky jsou častěji omezeny pouze na placentu (placentární mozaika) nebo jsou mateřskému původu. Pohlaví plodu (pokud je požadováno) je určeno s přesností více než 99 %.
Limitace testu:
cfDNA Test GENNET je genetický screeningový (orientační) test, který má svá omezení. Je jednou ze součástí prenatálního screeningového programu a v současné době není vhodný jako screeningový test první volby nebo při ultrazvukovém nálezu. Výsledek cfDNA Testu je nutno vždy interpretovat individuálně s ohledem na výsledky předchozích vyšetření a názor těhotné. Definitivní průkaz chromozomální odchylky plodu umožňuje pouze cílené (diagnostické) vyšetřením tkání plodu nejčastěji pomocí odběru plodové vody (amniocentézy).
Vždy doporučujeme podrobné ultrazvukové vyšetření ve 20. - 22. týdnu. Závěry genetického vyšetření by měly být konzultovány s klinickým genetikem nebo s ošetřujícím lékařem.
Přesnost vyšetření závisí na podílu cfDNA, která pochází z placenty (tzv. fetální frakce) a její kvalitě. Nízkou fetální frakci lze očekávat v časném těhotenství, v plazmě matek s vyšší hmotností nebo léčených léky snižujícími srážlivost krve a může přetrvávat celé těhotenství. Při nízké fetální frakci nebo snížené kvalitě cfDNA výsledek nemůže být vydán nebo není jednoznačný.
Výsledky testu cfDNA Test GENNET – zejména doprovodné nálezy - mohou být ovlivněny i řadou mateřských faktorů: např: transfuzí krve, orgánovou transplantací, terapií kmenovými buňkami, chirurgickým zákrokem, imunoterapií, onkologickým onemocněním, chronickým zánětem nebo vrozenými chromozomálními odchylkami.
Výsledky cfDNA Test GENNET u dvojčat mají dostatečnou citlivost a nízkou falešnou pozitivitu. Až u 4 % dvojčecích těhotenství však není možno test uzavřít. V případě Syndromu mizejícího dvojčete může být výsledek až v 5 % falešně pozitivní. Při vyšetření pohlaví u dvojčat je možno detekovat pouze přítomnost či absenci chromozomu Y. V případě přítomnosti chromozomu Y nelze zjistit, zda se jedná o sestru a bratra nebo dva bratry.
Přestože je metodika testu cfDNA Test GENNET založena na analýze celého genomu, určité regiony genomu jsou z analýzy vyloučeny. Jejich seznam je uveden v dokumentu VeriSeq NIPT Solution v2 Excluded Regions File na stránkách výrobce (illumina.com).
Test cfDNA Test GENNET nevyšetřuje částečné aneuploidie o velikosti menší než 7Mb.
Test nebyl validován pro:
• použití u troj- a vícečetných těhotenství,
• pro detekci polyploidie (zmnožení kompletních sad chromozomů, nejen jednoho chromozomu),
• detekci balancovaných chromozomálních přestaveb.
• detekci jiných než těchto aneuploidií pohlavních chromozomů: XO, XXX, XXY a XYY
• detekci uniparentální dizomie (plod zdědil oba chromozomy od jednoho rodiče),
• onemocnění plodu monogenní/polygenní chorobou.